气相色谱仪使用中气体纯度选择的一般原则如下：
1 从分析角度讲，微量分析比常量分析要求高，也就是说，气体中的杂质含量必须低于被分析组分的含量，如果用TCD分析10ppm的CO，则载气中的杂质总含量不得超过10ppm，因为99.999%纯度的气体则含0.001%的杂质，相当于10ppm，所以对于10ppm的痕量分析，载气的纯度应高于99.999%；在FID使用气体，碳氢化合物含量必须很低，载气中的大量氧杂质只要不对色谱柱造成影响，就不影响FID的性能，而操作ECD载气中的氧气和水的含量必须很低等。
2 毛细管柱分析比填充柱分析要求高。
3 程序升温分析比恒定温度分析要求高。
4 浓度型检测器比质量型检测器要求高。
5 配有甲烷装置的FID比单FID操作的对载气中的微量一氧化碳，二氧化碳要求要高的多。
6 从气相色谱仪寿命和保持气相色谱仪的高灵敏度讲，中高档仪器比低档仪器要求高。